一、目前开展效益审计遇到的困难与问题
（一）没有现成的审计操作模式可借鉴。效益审计与传统的财务收支审计基本原理一致，都是通过会计等信息资料的收集，对某一经济活动进行审计鉴定，作出客观评价。但审计目的、重点与方法以及具体操作要求不同。效益审计已成为当今世界审计的主流，但在我国目前尚处于尝试阶段，探索与中国实际相结合的绩效审计模式，是中国审计制度融入世界审计主流的重要条件，也是摆在当代审计人面前的一项重大课题。
（二）评价标准难以确定，具体指标的选择有难度。效益审计最显著的特点就是对审计对象经济活动的经济性和社会性、效率性和效果性等作出审计评价，而这必将涉及到如何运用具体的经济指标、确定评价标准的问题。由于效益审计的对象千差万别，衡量效益的批准、指标又很多，同样的项目会有不同的衡量标准，不同的审计人员会有不同理解与判断，得出不同的结论。
（三）信息资料的失真直接影响审计结果。我国财经领域的虚假行为还较为严重，特别是会计资料的失真行为，有一定的普遍性，这就给效益审计带来很大的困难。审计人员必须在完成对被审事项财政财务收支的真实合法，对不真实不合法事项重新进行调整的前提下，才能实施效益审计。因此，住处资料的失真对开展效益审计会带来很大的困难，将直接加大审计风险。
（四）审计人员素质滞后，跟不上形势发展的需要。效益审计对象的复杂多样性决定了审计人员必须具备多学科知识，由于长期以来财务收支审计占主导地位，对其他领域的知识运用不多，所以就目前而言，审计人员的知识面相对比较狭窄，这对开展效益审计工作将是一个很大的现实问题。
二、做好效益审计工作的几点看法
（一）上下联动，加强调研，为开展效益审计工作打下扎实的理论基础。加强效益审计的调研工作，基层审计机关要及时向上级审计机关反映在实践中遇到的困难和问题，提供丰富的第一手实践材料，并提出自己的看法与见解；上级审计机关要及时汇总并分析实践中遇到的困难和问题，听取和征求多方意见，集思广益，提出解决问题的思路与方法，制定出台有关开展效益审计工作的措施办法，以指导下级审计机关按统一规范要求开展效益审计工作。
（二）合理安排，循序渐进，逐步摸索效益审计新路子。效益审计是更高层次的审计监督，由传统的财务收支审计向效益审计发展，已成必然。但就我国目前的经济社会发展水平，对经济秩序状况以及审计工作质量和人员的总体素质而言，要达到这方面的要求，还有很长的路要走。所以在效益审计的试审阶段或者起步阶段，既不能操之过急，也不能裹足不前，要合理安排，循序渐进，逐步摸索出一条适合我国实际的效益审计新路子。
（三）加强培训，提高素质，逐步培养一支适应新形势新任务发展需要的具有多学科、复合型的审计人才。一方面要加强对现有审计人员的业务培训，针对不同行业培养多种专业人才；另一方面要积极引进工程建设、信息管理、财政金融等方面的专业人才，使审计人员专业知识结构逐步趋于合理，为更好地开展效益审计提供人才保证。
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